當其他國家已取消「疫苗通行證」、香港大學學者建議政府放棄疫苗通行證措施時，政府卻在宣布提前實施「疫苗通行證」第三階段，呼籲市民盡快接種疫苗，以及配合最新修訂的新冠病毒病疫苗接種安排。5月31日將會「疫苗通行證」第三階段，即睇睇打針注意事項！
提前實施「疫苗通行證」第三階段
第二階段的「疫苗通行證」早已在4月30日開始實施，市民在進入「疫苗通行證」涵蓋的指明處所，包括餐廳、髮型屋、超市等地方時，必須已接種第二劑疫苗及使用安心出行應用程式。第三階段「疫苗通行證」原定6月30日起實施，但政府為求令更多市民打第三針，決定提前至5月31日起實施，屆時所有「疫苗通行證」適用的一般人士均須已接種第三劑疫苗。
縮短第二、三針之間寬限期：9個月→6個月
還記得疫苗初次供市民接種時，打2針已經是「接種完成」，但來到今天，政府專家多次強調病毒變種快速、疫苗抗體會隨時間下降，因此政府專家「鼓勵」市民盡快打第三針，甚至縮短第二、三針之間寬限期，由當初打第二針後「疫苗通行證」在9個月內有效，縮短至6個月內有效。即已打了第二針的市民，接種後6個月內其「疫苗通行證」仍然有效，但他們如若滿6個月，就需要打第三針才可進入表列處所，不然就不能堂食、不能剪頭髮、不能看電影啦。
曾打二針的新冠康復者能獲豁免暫時不用再接種
早前的第五波有過百萬市民中招，根據衞生署指示，康復者在指定時間內可獲豁免，毋須打針亦能得到「疫苗通行證」。但不同年齡組別、不同接種史的市民都有不同安排：
| 實施日期／ 適用人士類別 | 由2022年3月20日至4月29日 | 由2022年4月30日至5月30日 | 2022年5月31日或之後 | |
| 18歲或以上人士 | 第一針 | 第二針 | (i) 第二針，如接種第二針後未滿6個月
(ii) 第三針，如接種第二針後滿6個月 |
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| 12至17歲人士 | 第一針 | (i) 第一針，如接種第一針後未滿6個月
(ii) 第二針，如接種第一針後滿6個月 |
(i) 第二針，如接種第二針後未滿6個月
(ii) 第三針，如接種第二針後滿6個月 |
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| 12歲或以上， 在康復後未滿6個月的康復者 | 無需額外接種要求 | |||
| 12歲或以上，在感染新冠肺炎前已打第二、三針的康復者 | 無需額外接種要求 | |||
| 12歲或以上，在康復後滿6個月的康復者 | 在感染新冠肺炎前沒有接種疫苗的康復者 | 第一針 | (i) 第一針，如在接種第一針後6個月內 (ii) 第二針，如在接種第一針後滿6個月
*已接種一針復必泰(BioNTech)疫苗的12至17歲人士，無需第二針接種要求 |
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| 在感染新冠肺炎前已接種第一針疫苗的康復者 | 無需額外接種要求 | 第二針 *已接種一針復必泰(BioNTech)疫苗的12至17歲人士，無需第二針接種要求 |
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針卡必須連結安心出行？康復者如何得到「疫苗通行證」？
政府指，假如市民未有將針卡連結到安心出行應用程式，可以以醫健通接種紀錄或紙本針卡代替；至於新冠肺炎康復者，假如已按指示向衞生署申報確診，無論是經快測或是深喉唾液等方法檢測，都可以到電子疫苗接種及檢測紀錄系統下載「康復紀錄二維碼」。康復者可將康復紀錄加入疫苗接種紀錄二維碼內，連結到安心出行應用程式，就能當作「疫苗通行證」使用。
醫學豁免證明書只接受電子版
假如經醫生診斷並不適合接種新冠疫苗，或個別康復者，都有機會獲醫生簽發醫學豁免證明書，持有者可於有效期內豁免於「疫苗通行證」的接種要求。而這些醫學豁免證明書都必須印有加密二維碼，不接受紙本豁免書，持有者可將二維碼連結到安心出行應用程式，當作「疫苗通行證」使用。